Фауна млекопитающих

Территорию ГНПП «Көлсай көлдері» и прилежащих участков населяют 50 видов млекопитающих (Шнитников, 1936; Огнев, 1940; Млекопитающие Казахстана, 1969-1985; Книга генетического фонда фауны Казахской ССР, 1989). К отряду Грызунов относятся  20 видов, Хищных – 12, Рукокрылых – 7, Парнокопытных – 5, Насекомоядных – 4, Зайцеобразных – 2 вида .         
 Список видов млекопитающих ГНПП «Көлсай көлдері» и прилежащих территорий 
Отряд
НАСЕКОМОЯДНЫЕ
INSECTIVORA
Семейство
Землеройковые
Soricidae
1
Малая бурозубка
Sorex minutus
2
Тяньшанская бурозубка
Sorex asper
3
Малая белозубка
Crocidura suaveolens
4
Обыкновенная кутора
Neomys fodiens
Отряд
РУКОКРЫЛЫЕ
CHIROPTERA
Семейство
Гладконосые рукокрылые
Vespertilionidae
5
Остроухая ночница
Myotis blythi
6
Усатая ночница
Myotis myctacinus
7
Серый ушан
Plecotus austriacus
8
Рыжая вечерница
Nyctalus noctula
9
Нетопырь-карлик
Pipistrellus pipistrellus
10
Поздний кожан
Eptesicus serotinus
11
Гобийский кожан
Eptesicus gobiensis
12
Двухцветный кожан
Vespertilio murinus
Отряд
 
ХИЩНЫЕ
 
CARNIFORA
Семейство
Псовые
Canidae
13
Волк
Canis lupus
14
Лисица
Vulpes vulpes
Семейство
Медвежьи
Ursidae
15
Бурый медведь
Ursus arctos
Семейство
Куньи
Mustelidae
16
Каменная куница
Martes foina
17
Горностай
Mustela erminea
18
Ласка
Mustela nivalis
19
Барсук
Meles meles
20
Выдра
Lutra lutra
Семейство
Кошачьи
Felidae
21
Пятнистая кошка
Felis lybica
22
Манул
Felis (otocolobus) manul
23
Рысь
Lynx lynx
24
Снежный барс
Uncia uncia
Отряд
 
ПАРНОКОПЫТНЫЕ
 
ARTIODACTYLA
Семейство
Свиные
Suidae
25
Кабан
Sus scrofa
Семейство
Оленьи
Cervidae
26
Сибирская косуля
Capreolus pygargus
27
Марал
Cervus elaphus
Семейство
 
Полорогие
Bovidae
28
Aрхар
Ovis ammon
29
Горный козел
Capra sibirica
Отряд
 
ГРЫЗУНЫ
RODENTIA
Семейство
Беличьи
Sciuridae
30
Обыкновенная белка
Sciurus vulgaris
31
Серый сурок
Marmota baibacina
Семейство
Соневые
Gliridae
32
Лесная соня
Dryomis nitedula
Семейство
Мышовковые
Sminthidae
33
Тяньшанская мышовка
Sicista tianschanica
Семейство
Cricetidae
Хомяковые
34
Серый хомячок
Сricetulus migratorius
35
Серебристая полевка
Alticola argentatus (roylei)
36
Тяньшанская лесная полевка
Clethrionomys centralis
37
Ондатра
Ondatra zibethicus
38
Степная пеструшка
Lagurus lagurus
39
Общественная полевка
Microtus socialis
 
40
Полевка-экономка
Microtus oeconomus
 
41
Обыкновенная полевка
Microtus arvalis
 
42
Киргизская полевка
Microtus kirgisorum
43
Узкочерепная полевка
Microtus gregalis
44
Обыкновенная слепушонка
Ellobius talpinus
Семейство
Мышиные
Muridae
45
Лесная мышь
Apodemus sylvaticus
46
Полевая мышь
Arodemus agrarius
47
Домовая мышь
Mus musculus
48
Серая крыса
Rattus norvegicus
Отряд
 LAGOMORPHA
ЗАЙЦЕОБРАЗНЫЕ
Семейство
Зайцы
Leporidae
49
Заяц-толай
Lepus tolai
Семейство
Пищухи
Ochotonidae
50
Красная пищуха
Ochotona rutila
Следует отметить недостаточную изученность видового состава  млекопитающих данного региона, особенно мышевидных грызунов и рукокрылых, и при проведении детальной инвентаризации териофауны ГНПП в дальнейшем список видов, очевидно несколько увеличится.
Исследуемый регион находится в пределах Восточно-Тяньшанского участка Палеарктической зоогеографической области (Афанасьев, 1960). Здесь преобладают представители лесной фауны (18 видов), затем идут широко распространенные в Палеарктике виды (10), обитатели каменистых биотопов (6), мезофильные виды южных стран (6), горно-степные (4), пустынные (4) и акклиматизированные (2) виды. Характерные представители лесной фауны – марал, косуля, рысь, медведь, лесная соня, лесная и полевая мыши, малая и тяньшанская бурозубки и др.; широко распространенные виды – волк, лисица, барсук, ласка, выдра, домовая мышь, усатая ночница, нетопырь-карлик и др.; типичные обитатели каменистых биотопов – горный козел, снежный барс, каменная куница, красная пищуха, серебристая полевка; мезофильные виды —  кабан, малая белозубка, остроухая ночница и др.; обитатели горных степей – архар, серый сурок; представители пустынной фауны – заяц-толай, пятнистая кошка;  акклиматизированные виды – ондатра и белка.
Редких видов и подвидов зверей, занесенных в международные, национальные и региональные Красные списки и книги (см. далее)  — 10. Примерно к середине прошлого века в регионе исчез один вид – красный волк (Cuon alpinus).
Объектами охоты являются все виды зверей из отрядов Парнокопытных и Хищных (исключая «краснокнижных»), а также белка, серый сурок, ондатра и зая-толай.